Off-Line Base Caller 1.8

Nach der Restrukturierung von Illuminas Software gibt es jetzt den Off-Line Base Caller. Dieser kann wie folgt installiert werden. Für diese Beschreibung wird vorausgesetzt, das Casava wie hier beschrieben auf dem Computer installiert wurde.

Installation FFT Bibliothek.

• tar xfz fftw-3.1.2.tar.gz 
• cd fftw-3.1.2
• ./configure --enable-single
• make
• su
• make install
• exit

Installation von OLB.

• tar xfz OLB-1.8.0.tar.gz
• cd ../../OLB-1.8.0
• make
• su
• make install
• exit

Testen von OLB mit Testdaten.

• tar xfjv Illumina_Genome_Analyzer_Validation_Dataset_v_1_8_0.tar.bz2
• cd Illumina_Genome_Analyzer_Validation_Dataset_v_1_8_0
• su
•  ./validate.sh /home/mirkoebert/illumina/olb/OLB-1.8.0